関東大震災よりも前の1916年に完成した建物であり、本郷地区キャンパスに現存する最古の校舎である。設計は山口孝吉(東京帝国大学営繕課長)。1984年に内部が改装された。現在は化学教室の規模が拡大したため、隣接して化学本館（1962年完成）・化学西館（1983年完成）が建てられ、一体的に使用されている。化学東館は古典主義建築であり、内田ゴシックとは趣向が異なる。
