1915年、三井合名会社が1892年建造の森源三邸を購入し三井別邸とする。 1936年、三井が旧森邸（旧館）の隣に「三井別邸新館」を建設。それがこの建物である。 1945年にアメリカ軍に接収。1952年、札幌市の所有となる。 1953年、北海道の所有となり、旧館取り壊し。新館を知事公館として使用開始。 1999年、登録有形文化財指定。
