1859年、初代ロシア領事ゴシュケヴィツチは、現在の教会所在地にロシア領事館の敷地を確保。その附属聖堂として1860年、日本で最初の正教会の聖堂「主の復活聖堂」が建てられた。1907年の函館大火で焼失した初代聖堂に代わって、1916年、現在の聖堂が建てられた。1983年、国の重要文化財に指定された。
